专任教师

陈振夏

访问次数:发布日期:2019-09-19

陈振夏 博士教授 博士生导师

AG真人国际精准营养与代谢创新团队陈振夏课题组成立于2016年9月,主要利用“果蝇-脊椎动物-人”比较基因组学研究策略,通过动物和人类营养健康的多组学数据整合分析,评估“基因-性别-营养”相互作用对机体的影响及其分子机制,力求为国民提供个性化的膳食营养方案,治未病。

实验室主要研究方向包括:

1.食品营养健康效用挖掘;

2.动物表型组学技术开发;

3.非编码结构元件功能和演化研究。


教育经历

2006-2011北京大学生命科学技术学院生物信息中心理学博士学位

2002-2006AG真人国际生命科学技术学院国家生命科学与技术人才培养基地理学学士学位

2003-2006武汉大学新闻传播学院学院新闻学文学学士学位


工作经历

2022至今Briefings in Bioinformatics副主编(Deputy Editor)

2021-2022Briefings in Bioinformatics副编辑(Associate Editor)

2016-至今AG真人国际教授、博士生导师

2011-2016美国国立卫生研究院消化、糖尿病、肾脏病研究所博士后


讲授课程

《演化生物学》《生物信息学》《生命科学导论》《生命科学发展简史》


代表性科研论文

1. Zhang R#, Tu YX#, Ye D, Gu Z,Chen ZX*, Sun Y*. 2022. A Germline-specific Regulator of Mitochondrial Fusion is Required for Maintenance and Differentiation of Germline Stem and Progenitor Cells.Advanced Science.

2. Chen L#, Luo Z#, Zhao C#, Li Q, Geng Y, Xiao Y, Chen MK, Li L,Chen ZX*, Wu M*. 2022. Dynamic Chromatin States Coupling with Key Transcription Factors in Colitis‐Associated Colorectal Cancer.Advanced Science.

3. Qian SH, Xiong YL, Chen L, Geng YJ, Tang XM,Chen ZX*. 2022. Dynamic Spatial-temporal Expression Ratio of X Chromosome to Autosomes but Stable Dosage Compensation in Mammals.Genomics Proteomics Bioinformatics.

4. Luo ZH#, Zhu LD#, Wang YM#, Hu Qian S, Li M, Zhang W*,Chen ZX*. 2022. DSEATM: drug set enrichment analysis uncovering disease mechanisms by biomedical text mining.Brief Bioinform.

5. Li Z#, Qian SH#, Wang F, Mohamed HI, Yang G,Chen ZX*, Wei D*. 2022. G-quadruplexes in genomes of viruses infecting eukaryotes or prokaryotes are under different selection pressures from hosts.J Genet Genomics49: 20-29.

6. Liu X#, Chen L#, Wang T, Zhou J, Li Z, Bu G, Zhang J, Yin S, Wu D, Dou C et al. 2021. TDG is a pig-specific epigenetic regulator with insensitivity to H3K9 and H3K27 demethylation in nuclear transfer embryos.Stem Cell Reports.

7. Tong YB#, Shi MW#, Qian SH#, Chen YJ, Luo ZH, Tu YX, Xiong YL, Geng YJ, Chen C,Chen ZX*. 2021. GenOrigin: A comprehensive protein-coding gene origination database on the evolutionary timescale of life.J Genet Genomics48: 1122-1129.

8. Luo ZH, Shi MW, Yang Z, Zhang HY,Chen ZX*. 2020. pyMeSHSim: an integrative python package for biomedical named entity recognition, normalization, and comparison of MeSH terms.BMC Bioinformatics21(1): 252.

9. Chen L, Wang L, Cheng Q, Tu YX, Yang Z, Li RZ, Luo ZH,Chen ZX*. 2020. Anti-masculinization induced by aromatase inhibitors in adult female zebrafish.BMC Genomics21(1): 22.

10. Shi MW#, Zhang NA#, Shi CP, Liu CJ, Luo ZH, Wang DY, Guo AY*,Chen ZX*. 2019. SAGD: a comprehensive sex-associated gene database from transcriptomes.Nucleic Acids Res47(D1): D835-D840.

11.Chen ZX, Oliver B, Zhang YE, Gao G, Long M*. 2017. Expressed Structurally Stable Inverted Duplicates in Mammalian Genomes as Functional Noncoding Elements.Genome Biol Evol9(4): 981-992.

12.Chen ZX, Oliver B*. 2015. X Chromosome and Autosome Dosage Responses in Drosophila melanogaster Heads.G3(Bethesda) 5(6): 1057-1063.

13.Chen ZX#, Sturgill D#, Qu J, Jiang H, Park S, Boley N, Suzuki AM, Fletcher AR, Plachetzki DC, FitzGerald PC et al. 2014. Comparative validation of the D. melanogaster modENCODE transcriptome annotation.Genome Res24(7): 1209-1223.

14.Chen ZX, Golovnina K, Sultana H, Kumar S, Oliver B*. 2014. Transcriptional effects of gene dose reduction.Biol Sex Differ5(1): 5.

15.Chen ZX, Zhang YE, Vibranovski M, Luo J, Gao G, Long M*. 2011. Deficiency of X-linked inverted duplicates with male-biased expression and the underlying evolutionary mechanisms in theDrosophilagenome.Mol Biol Evol28(10): 2823-2832.


发表社科文章

1.龙漫远,陈振夏.达尔文和他改变的世界.科学文化评论. 6(4): 13-26 (2009).

2.陈振夏.大学生课外活动参与状况调查与研究.AG真人国际学报(社科版), 5,6: 118-121 (2005).


其他发表文章

1.陈振夏.果蝇的祖先天生双性恋?牛顿科学世界, (2010)

2.陈振夏. Y染色体少了,男人要没了?南都周刊, (2009)

3.陈振夏.兴趣不是奢侈品. ——从喜欢花鸟虫鱼的日本皇子说起.科学时报, (2008).

4.陈振夏.《在燕园留下的第一次》.霍晓丹编著.《绚彩燕园青春北大——60位北大优秀毕业生的校园记忆》,北京大学出版社(2011).


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